翁祥初，原籍福建省上杭縣。1929年加入中國共產(chǎn)黨。1930年參加了第二次攻打長沙的戰(zhàn)斗，隨后擔(dān)任紅五軍團(tuán)第十四軍四十師炮兵連指導(dǎo)員。1933年4月，他進(jìn)入了瑞金紅軍大學(xué)進(jìn)行學(xué)習(xí)，并歷任團(tuán)政治處主任和團(tuán)政委等職務(wù)。

長征期間，翁祥初歷任紅八軍團(tuán)野戰(zhàn)醫(yī)院政委、紅一軍團(tuán)二師政治部巡視團(tuán)主任、紅一軍團(tuán)炮兵連指導(dǎo)員等職，1935年12月，他被任命為紅一軍團(tuán)野戰(zhàn)醫(yī)院黨總支書記。1937年8月，他擔(dān)任中央軍委警衛(wèi)營教導(dǎo)員。

抗日戰(zhàn)爭勝利后，翁祥初先后擔(dān)任晉察冀軍區(qū)第二縱隊(duì)一旅政治部主任、晉察冀軍區(qū)第三縱隊(duì)政治部組織部部長、華北軍區(qū)補(bǔ)訓(xùn)兵團(tuán)政治部組織部部長等職。中華人民共和國成立后，他歷任華北軍區(qū)后勤部軍需部政委、華北軍區(qū)后勤部政治部副主任和華北軍區(qū)后勤部油料部政委等職。1997年在北京逝世，享年90歲。